Su naturaleza neutra y su relativa inocuidad hacen de los amonios cuaternarios un compuesto ideal para la desinfección de superficies y ambientes. Entre sus principales ventajas encontramos: Amplio espectro bactericida, fungicida y virucida.
Los amonios cuaternarios son químicos de uso común en productos de limpieza como desinfectantes, toallitas, aerosoles y otros de uso doméstico y comercial para eliminar microorganismos nocivos para la salud.
En bajas concentraciones se pueden utilizar como alguicidas, bactericidas, fungicidas y esporicidas para la formulación de desinfectantes que ayuden a reducir la propagación de microorganismos, así como el riesgo de contaminación cruzada de alimentos, y para desinfectar áreas de trabajo.
En hospitales su uso es frecuente en el saneamiento general de utensilios, equipamiento industrial, desinfección de instrumentos médicos, quirófanos, inodoros, laboratorios, desinfección de la ropa y sábanas.
En la industria alimentaria se utiliza como agente de limpieza en las plantas procesadoras de carne, alimentos y lácteos.
Los usos de las generaciones de amonios cuaternarios son:
- Primera generación. Cuenta con un moderado espectro de acción biocida y no es biodegradable, por lo que se utiliza como desinfectante doméstico y comercial tanto en soluciones, como en toallitas desinfectantes.
- Segunda generación. Si bien estos desinfectantes tienen mayor eficacia que los anteriores, actualmente no se utilizan a nivel comercial.
- Tercera generación. Ya que se elaboran con detergentes iónicos cuentan con mayor poder limpiador y se utilizan para la formulación de desinfectantes con menor resistencia microbiana y toxicidad. Se utilizan para formulaciones a base de amonio.
- Cuarta generación. Su actividad germicida es mayor, crean poca espuma, son tolerantes a las cargas de proteína y su nivel de toxicidad es muy bajo, por lo que se usan para la limpieza en la industria alimentaria.
- Quinta generación. Son los germicidas más potentes en condiciones ambientales difíciles y son amigables con el medio ambiente, por lo que se utilizan para el tratamiento de aguas duras.